フラット３５（買取型）
（A）MBS（資産担保証券）を購入した投資家に支払う利息、（B)機構が事業運営するための費用、（C)取扱金融機関の手数料の3つで構成されています。
このうち取扱金融機関の手数料の率はそれぞれの金融機関が独自に設定しているため、金融機関ごとに金利が違います。

フラット３５（保証型）
取扱金融機関が独自に設定しているため、金融機関ごとに金利が違います。